海安縣中醫院于1981年選址興建，1983年4月獨立建院。建院初期僅有46名職工、20張床位。建院以來，在黨的改革開放方針和新時期衛生工作方針的指引下，在縣委、縣政府和各級衛生主管部門的正確領導下，在社會各界的關心支持下，醫院建設得到了長足的發展，1994年8月成為二級甲等中醫院；1997年8月成為國家級愛嬰醫院；2007年11月成為南京中醫藥大學教學醫院；2009年11月，醫院與新疆伊寧市維吾爾醫院締結“友好醫院”，進行對口支援。2013年1月7日成為三級乙等中醫醫院。 醫院現有占地面積25290.24m2，建筑面積29555m2。其中業務用房建筑面積24392m2，占82.5%。主要建筑物有門急診樓、綜合病房樓和醫技樓。醫院現有職工547人，其中，衛生技術人員475人，占職工總人數的87%。衛生技術人員中，高級職稱89人，中級職稱138人。全院從事臨床的執業醫師136人，其中中醫類別執業醫師82人，占60.3%。剔除口腔科、產科、麻醉科執業醫師人數，中醫類別執業醫師占68.3%。醫院有享受國務院特殊津貼者1名，省名中醫4名，市名中醫5名，省“333”工程人才1名；市縣級中青年技術拔尖人才7名;市醫學領軍人才1名，醫學重點人才1名。 醫院編制床位400張，設有11個病區、一個綜合手術室；有17個一級臨床科室（內科、外科、骨傷科、婦產科、兒科、針灸科、肛腸科、康復科、推拿科（含小兒推拿）、眼科、耳鼻喉科、口腔科、皮膚科、腫瘤科、麻醉科、急診科、感染性疾病科、重癥醫學科）；其中針灸科為全國第二批農村醫療機構中醫特色?？疲▽２。┙ㄔO單位、江蘇省中醫重點?？平ㄔO單位；骨傷科、針灸科、脾胃病科、腦病科為南通市中醫重點?？疲恍牟】茷槟贤ㄊ兄嗅t重點?？平ㄔO單位；有肛腸科、兒科、腎病科等縣級中醫重點?？?個；有糖尿病、膽石癥內病外治、甲狀腺病、脾胃病、肝膽病、腎病、椎間盤突出癥、男性不育癥、風濕病、肛腸疾病等30多個具有中醫特色優勢的專科專病，有醫技科室8個（藥學部、醫學影像科、醫學檢驗科、病理科、手術室、輸血科、營養科和功能檢查科），一個健康體檢中心。醫院有東芝核磁共振、醫用直線加速器、移動式C型X光機、六排螺旋CT、CR、DR、數字胃腸X光機、電子腹腔鏡、電子關節鏡、電子胃（腸）鏡等大中型醫療設備。